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ZipHelix(概述总结)

提供一套软件产品,为管理大型基因组数据集提供了高效、安全和合规的解决方案,将高性能数据压缩与强大的安全和访问控制功能相结合,在医疗保健、研究和生物技术等各个领域都至关重要。这些工具可无缝集成到现有的基础设施和工作流程中,增强了各种云环境和内部部署环境中基因组数据的管理和利用。

ZipHelix

ZipHelix 是 Genomelight 公司的主要软件产品,专注于应对日益增长的基因组数据量所带来的挑战。它通过压缩基因组数据大大节省了存储和数据传输费用,与 BAM 和 Gzip压缩的 FASTQ 文件相比,通常可减少 60% 至 90%,与原始 FASTQ 文件相比,可减少高达 96%。ZipHelix可与现有的存储基础设施和生物信息学管道无缝集成,是管理二代和三代测序(NGS)数据的可扩展解决方案。

GeL-Link

GeL-Link 是一个功能强大的虚拟文件访问系统,有助于将 BAM 和 FASTQ.gz 数据迁移到更高效的压缩格式。使用 ZipHelix 压缩 BAM 文件后,GeL-Link 会提供压缩文件的高性能虚拟文件视图。该虚拟文件保留了原始文件的名称和位置,可由 Linux 工具链、管道和基因组浏览器透明地使用。GeL-Link 的云版还能像访问本地文件一样访问存储在云中的远程文件,而无需先下载文件。

GeL-Link 云版

该版本的 GeL-Link 可处理未压缩数据和压缩数据,支持多种云平台,包括 AWS、Azure、GCP、私有云和混合云。它允许将数据压缩并直接流式传输到对象存储中,并提供流式随机访问对象存储中的这些数据,就像访问普通文件一样,并在必要时进行即时解压缩。这一功能使用户无需在使用前从对象存储中下载数据。

ZipHelix 保护

为基因组数据管理增加了多层安全性、访问控制和审计。它通过细粒度访问控制和深度审计功能确保数据安全。该软件使用符合 FIPS 140-2 标准的 AES-256 区域加密技术,防止未经授权访问基因组数据。管理员可使用 ZipHelix 保护管理服务器实时控制访问。该工具还通过应用强大的加密功能和创建访问记录简化了相关法规的合规性,从而证明必要的安全协议已经到位。

BayesCal

BayesCal 是 ZipHelix 提供的另一项功能,它采用贝叶斯方法对测序仪误差进行更全面的后验估计。这不仅能保持整个 ROC 曲线的基因分型准确性,还能改善压缩效果,与标准无损压缩相比,压缩率可额外提高 30-70%。

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